明朝时期的东厂、西厂和锦衣卫都是特务机构，它们之间存在联系和区别，主要体现在以下几个方面：
联系
目的：三者都是为了加强皇权，监视、侦察和镇压百官的不法行为，确保皇位稳固。
人员构成：东厂和西厂的人员都来自于锦衣卫。
独立性：这三个机构都独立于基本的司法机构，直接隶属于皇帝领导，与六部平起平坐，甚至在很多阶段权势超过六部。
区别
建立时间：
锦衣卫：成立于1382年，由明太祖朱元璋设立。
东厂：成立于1420年，由明成祖朱棣设立。
西厂：成立于1477年，由明宪宗朱见深设立。
首领来源：
锦衣卫：首领主要是皇帝的亲信武将，属于外臣。
东厂和西厂：首领是皇帝身边的信任太监，属于内臣。
职责：
锦衣卫：主要负责侦察、逮捕、审问等活动，还介入军中，担任收集情报、策反敌将等工作。
东厂：主要职责是刑狱审讯以及社会监视，可随意监督缉拿臣民。
西厂：主要职责是探查侦查臣民的言行。
权力关系：
锦衣卫、东厂、西厂都直接对皇帝负责，不经司法机关批准，可随时监督缉拿臣民。
东厂和西厂在后期发展过程中，权力逐渐超过锦衣卫，尤其是西厂，在明宪宗时期设立后，权力一度超过东厂。
总结：
锦衣卫、东厂和西厂虽然都是明朝的特务机构，且目的和职责有相似之处，但在建立时间、首领来源、职责和权力关系上存在明显的区别。锦衣卫由武将担任首领，主要负责军事侦察和情报收集；东厂由太监担任首领，侧重于监视和打击朝廷内部的不法行为；西厂也是由太监担任首领，但权力和势力在后期超过东厂，主要负责民间的侦察和监视。三者共同构成了明朝严密的特务统治体系，对皇权的巩固起到了重要作用。