李莲花的武功水平是 非常高的。他自幼父母双亡，师承不详，但仅十五岁就武功大成，独自战胜血域天魔，跻身天下第一高手。十七岁创建四顾门，成为一门之主，仅仅用了三年就结束了正派的武林纷争。二十岁当上了武林盟主，被江湖上无数人所膜拜，剑术精妙绝伦，快若惊鸿，被人称为剑神。
尽管在剧情结尾处，李莲花的武功并没有完全恢复，十年前孤傲无双、惊才绝艳的四顾门门主李相夷，和对头笛飞声决战，掀起江湖的惊涛骇浪，谁知在大战前夕，李相夷被门徒下毒，重伤坠海消失，十年后他武功全废、换了容貌，成“神医”李莲花重归江湖。但即便如此，他依然有着极高的战斗力，只是武功仅剩一成左右，但也不是普通人所能企及的。
因此，综合来看，李莲花的武功水平在小说中被描述为极高的，尽管在剧情后期受到了一些影响，但他的实力仍然非常强大，是江湖中的传奇人物。