标注了参考文献仍然显示重复，可能是由以下几个原因造成的：
引用格式不正确：
参考文献的格式对于论文的查重结果有很大影响。如果参考文献格式不符合要求，查重系统可能会将其误判为重复内容。
引用过多：
在论文中过度引用同一篇文献，或者在同一章节中多次引用同一篇文献，都可能导致重复率升高。
查重系统算法：
不同的查重系统有不同的算法，有些系统对文本相似度的判断较为严格，可能会将一些合理的引用误判为重复。
文献库重叠：
如果引用的文献与查重系统所拥有的文献库中存在相似的文献，系统可能会将其检测为重复。
直接引用过多：
在论文中直接引用他人的原话或未进行适当改写的内容，查重系统会将其视为重复内容。
虚假引用：
如果引用的文献并不存在或者引用信息不准确，查重系统可能会将其误判为重复内容。
为了解决参考文献重复的问题，可以采取以下措施：
检查并修正引用格式：确保所有参考文献的格式符合学校或期刊的要求。
合理引用：避免过度引用同一篇文献，尽量使用自己的语言对文献内容进行改写。
选择合适的查重系统：不同的查重系统有不同的检测原理和算法，可以尝试使用不同的系统进行查重，以获得更准确的结果。
使用文献管理软件：利用文献管理软件（如EndNote、Zotero等）来检测和管理参考文献，避免重复。
通过以上方法，可以有效降低论文的重复率，确保学术成果的原创性。